Muzeum Strefa Historyczna Wolne Miasto Gdańsk jest filią Towarzystwa Przyjaciół Gdańska, współpracuje zarówno z instytucjami miejskimi między innymi GAIT, GIWK jak i organizacjami pozarządowymi takimi jak Fundacja Forum, Nasz Gdańsk, Fundacja Bursztynowe Serce
